Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SP140Q13342 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SP140Q13342 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SP140Q13342 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SP140Q13342 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SP140Q13342 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SP140Q13342 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SP140Q13342 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SP140Q13342 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SP140Q13342 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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