Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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