Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGXB3Q12766 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGXB3Q12766 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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