Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
VAX2Q9UIW0 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms