Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC5Q9UII4 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms