Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
VN1R3Q9BXE9 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VN1R3Q9BXE9 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms