Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PHF3Q92576 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PHF3Q92576 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PHF3Q92576 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PHF3Q92576 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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