Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SOGA3Q5TF21 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOGA3Q5TF21 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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