Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC96Q2M329 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC96Q2M329 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms