Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPN21Q16825 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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