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| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP467-201 | ENST00000391274 | 118 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SERF1AP1-201 | ENST00000514575 | 187 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU7-99P-201 | ENST00000516271 | 62 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU1-142P-201 | ENST00000516682 | 145 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| PTPN21 | Q16825 | DEFB108E-201 | ENST00000524692 | 240 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | U6.108-201 | ENST00000637764 | 58 nt | BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AP000553.5-201 | ENST00000641933 | 54 nt | BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | KPNA5-202 | ENST00000368564 | 11311 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SLC25A46-204 | ENST00000504098 | 2345 nt | TSL 5 BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-117P-201 | ENST00000365415 | 107 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AC010409.1-201 | ENST00000487382 | 476 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-191P-201 | ENST00000516295 | 94 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU7-128P-201 | ENST00000517247 | 62 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | HMSD-204 | ENST00000526932 | 162 nt | TSL 3 BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SAGE1-202 | ENST00000370709 | 2879 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RGPD1-204 | ENST00000559485 | 5247 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC008555.8-201 | ENST00000623602 | 2168 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA33-201 | ENST00000363664 | 130 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP160-201 | ENST00000364866 | 120 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.368-201 | ENST00000365547 | 113 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.456-201 | ENST00000384232 | 111 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-574P-201 | ENST00000384265 | 107 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RNU6-855P-201 | ENST00000410395 | 104 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | SCARNA24.2-201 | ENST00000516968 | 130 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AL512605.2-201 | ENST00000592972 | 256 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | TP73-AS1.1-201 | ENST00000611447 | 161 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | GS1-279B7.1-204 | ENST00000641809 | 378 nt | BASIC | 2.43 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LIFR-201 | ENST00000263409 | 10089 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | OR2L2-202 | ENST00000641771 | 4300 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC003984.1-201 | ENST00000450977 | 4104 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA8-201 | ENST00000384574 | 139 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC108729.3-201 | ENST00000513484 | 108 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6ATAC9P-201 | ENST00000516210 | 116 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SUB1P4-201 | ENST00000566062 | 339 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC062037.2-201 | ENST00000610137 | 73 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | KTN1-207 | ENST00000438792 | 4449 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | UBE2WP1-201 | ENST00000362030 | 340 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIRLET7G-201 | ENST00000362280 | 84 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA16B-201 | ENST00000364674 | 135 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.341-201 | ENST00000365341 | 102 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA64-201 | ENST00000384674 | 134 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC245047.4-201 | ENST00000433189 | 144 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1132P-201 | ENST00000459214 | 107 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU7-94P-201 | ENST00000459576 | 63 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC091959.1-201 | ENST00000495857 | 238 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL163195.1-201 | ENST00000496941 | 348 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA27.4-201 | ENST00000516650 | 95 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC084364.2-201 | ENST00000546924 | 395 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR5007-201 | ENST00000583098 | 95 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SLCO1B3-202 | ENST00000381545 | 2805 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | TDRD15-202 | ENST00000622654 | 5805 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SERPINI2-207 | ENST00000476257 | 1837 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.02 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.14-201 | ENST00000362415 | 103 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.310-201 | ENST00000365063 | 113 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA6-201 | ENST00000384033 | 151 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-376P-201 | ENST00000384731 | 106 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL355497.1-201 | ENST00000406262 | 551 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-295P-201 | ENST00000516901 | 104 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC136628.3-201 | ENST00000521868 | 290 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |