Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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ECM1Q16610 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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ECM1Q16610 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ECM1Q16610 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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