Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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