Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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SSX1Q16384 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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SSX1Q16384 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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SSX1Q16384 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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SSX1Q16384 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SSX1Q16384 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SSX1Q16384 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SSX1Q16384 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SSX1Q16384 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SSX1Q16384 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SSX1Q16384 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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