Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNHIT3Q15649 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZNHIT3Q15649 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms