Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SYCP1Q15431 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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SYCP1Q15431 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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SYCP1Q15431 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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SYCP1Q15431 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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SYCP1Q15431 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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