Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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