Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.5 ms