Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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