Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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