| RUNX3 | Q13761 | AL157834.3-201 | ENST00000615543 | 103 nt | BASIC | 1.51 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004467.1-201 | ENST00000615678 | 330 nt | BASIC | 1.51 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ASPN-202 | ENST00000375544 | 2470 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.51 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYLC2-204 | ENST00000612124 | 1817 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.286-201 | ENST00000364813 | 102 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.287-201 | ENST00000364853 | 94 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA48.1-201 | ENST00000390879 | 135 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355796.1-201 | ENST00000406706 | 323 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP501-201 | ENST00000410990 | 112 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P38-201 | ENST00000418090 | 167 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098869.1-201 | ENST00000481627 | 292 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPS35P2-201 | ENST00000508242 | 191 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1041P-201 | ENST00000516254 | 102 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.721-201 | ENST00000517207 | 102 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-12P-201 | ENST00000517216 | 168 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003715.1-201 | ENST00000532109 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3122-201 | ENST00000577243 | 73 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4300-201 | ENST00000581016 | 96 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008737.2-201 | ENST00000599446 | 118 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355297.3-201 | ENST00000604082 | 446 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353149.1-201 | ENST00000610667 | 244 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ST7-AS1_1.1-201 | ENST00000611142 | 116 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Six3os1_7.1-201 | ENST00000621512 | 201 nt | BASIC | 1.5 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANKRD36-208 | ENST00000639751 | 3090 nt | TSL 5 BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.124-201 | ENST00000363339 | 93 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD115-30-201 | ENST00000364117 | 82 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.439-201 | ENST00000384119 | 94 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.526-201 | ENST00000384572 | 110 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-30P-201 | ENST00000410245 | 143 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P34-201 | ENST00000437647 | 269 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP5J2P3-201 | ENST00000451550 | 258 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM132D-AS1-202 | ENST00000510001 | 293 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011406.1-201 | ENST00000512440 | 370 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-327P-201 | ENST00000516270 | 127 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNVU1-2-201 | ENST00000516326 | 135 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005176.2-201 | ENST00000596933 | 147 nt | BASIC | 1.49 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF702P-202 | ENST00000434269 | 1966 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MCMDC2-207 | ENST00000492775 | 1831 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP276-201 | ENST00000362580 | 94 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.64-201 | ENST00000362845 | 102 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD81.1-201 | ENST00000363064 | 77 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.145-201 | ENST00000363527 | 102 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.162-201 | ENST00000363683 | 102 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.222-201 | ENST00000364264 | 102 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1175P-201 | ENST00000365200 | 107 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA63.7-201 | ENST00000365579 | 123 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.380-201 | ENST00000365663 | 111 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.422-201 | ENST00000384054 | 114 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.446-201 | ENST00000384178 | 104 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR215-201 | ENST00000384858 | 110 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136985.1-201 | ENST00000424592 | 395 nt | TSL 3 BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073910.1-201 | ENST00000445047 | 438 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND5P22-201 | ENST00000458380 | 195 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01399-202 | ENST00000458450 | 244 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD65B-201 | ENST00000459126 | 73 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023790.1-201 | ENST00000482174 | 347 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093893.1-201 | ENST00000505781 | 510 nt | TSL 5 BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025465.3-201 | ENST00000510570 | 311 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC100807.1-201 | ENST00000517640 | 552 nt | TSL 5 BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUMO2P18-201 | ENST00000518873 | 252 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027419.1-201 | ENST00000522976 | 328 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4299-201 | ENST00000577899 | 72 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC136443.5-201 | ENST00000603741 | 370 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005828.6-201 | ENST00000606610 | 232 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.772-201 | ENST00000606692 | 102 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353770.2-201 | ENST00000620024 | 78 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U6.115-201 | ENST00000636045 | 103 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR338-201 | ENST00000636369 | 67 nt | BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TFEC-204 | ENST00000457268 | 6309 nt | TSL 3 BASIC | 1.48 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPN22-203 | ENST00000460620 | 1794 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-862P-201 | ENST00000362804 | 105 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U8.1-201 | ENST00000362843 | 134 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.183-201 | ENST00000363882 | 113 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.361-201 | ENST00000365515 | 120 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA20B-201 | ENST00000384220 | 132 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL358176.2-201 | ENST00000425769 | 204 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPGP13-201 | ENST00000442212 | 177 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-128P-201 | ENST00000517247 | 62 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022441.3-201 | ENST00000605737 | 136 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFAT-AS1_2.1-201 | ENST00000613742 | 201 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR376A1-201 | ENST00000616574 | 68 nt | BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KTN1-204 | ENST00000395311 | 4516 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.47 | □□□□□ -2.17 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000648.3-201 | ENST00000623539 | 4507 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU2-30.2-201 | ENST00000362805 | 70 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU2_19.2-201 | ENST00000363024 | 80 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.243-201 | ENST00000364481 | 109 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.276-201 | ENST00000364732 | 109 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA8-201 | ENST00000384574 | 139 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-417P-201 | ENST00000384712 | 107 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1105P-201 | ENST00000384774 | 107 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD115-46-201 | ENST00000390982 | 71 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-54P-201 | ENST00000410299 | 190 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP475-201 | ENST00000410568 | 110 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158823.1-201 | ENST00000418441 | 478 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008134.1-201 | ENST00000420943 | 193 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP6-201 | ENST00000446637 | 472 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPE1P25-201 | ENST00000455484 | 251 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-155P-201 | ENST00000516347 | 100 nt | BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356133.2-201 | ENST00000521572 | 371 nt | TSL 3 BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MDM2-232 | ENST00000544561 | 213 nt | TSL 5 BASIC | 1.46 | □□□□□ -2.18 | | |