Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
RUNX3Q13761 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms