Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms