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| NEUROD1 | Q13562 | RNU2-58P-201 | ENST00000516403 | 183 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-197P-201 | ENST00000516680 | 100 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1098P-201 | ENST00000516772 | 96 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-91P-201 | ENST00000607774 | 107 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL138880.2-201 | ENST00000616214 | 239 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ZNF271P-202 | ENST00000465539 | 1970 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC093010.3-201 | ENST00000570269 | 15214 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NEUROD1 | Q13562 | AP000567.1-201 | ENST00000406413 | 156 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NEUROD1 | Q13562 | AC010099.1-201 | ENST00000455434 | 375 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP402-201 | ENST00000517148 | 110 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | HDX-206 | ENST00000506585 | 6158 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | TMEM232-201 | ENST00000455884 | 2501 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1323P-201 | ENST00000384025 | 107 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NEUROD1 | Q13562 | MIR548A3-201 | ENST00000385297 | 97 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | TRAV41-201 | ENST00000390468 | 336 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NEUROD1 | Q13562 | NDUFA5P6-201 | ENST00000542110 | 379 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL021707.8-201 | ENST00000609428 | 183 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NEUROD1 | Q13562 | CYLC2-201 | ENST00000374798 | 2171 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | GABRG2-208 | ENST00000638552 | 3710 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC007256.1-201 | ENST00000392253 | 2765 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-859P-201 | ENST00000362728 | 107 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.91-201 | ENST00000363042 | 107 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-309P-201 | ENST00000364573 | 106 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.432-201 | ENST00000384087 | 111 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR196B-201 | ENST00000384852 | 84 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR548A1-201 | ENST00000385041 | 97 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC063976.3-201 | ENST00000426849 | 329 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MTCO1P44-201 | ENST00000441935 | 243 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC116666.1-201 | ENST00000453915 | 551 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | HMGN2P16-201 | ENST00000456802 | 261 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPS26P55-201 | ENST00000471178 | 356 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC005972.2-201 | ENST00000604690 | 348 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | snoZ196.1-201 | ENST00000625269 | 89 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | VTRNA1-1-201 | ENST00000363120 | 99 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP184-201 | ENST00000411071 | 108 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
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| NEUROD1 | Q13562 | SNORD65B-201 | ENST00000459126 | 73 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.651-201 | ENST00000459380 | 103 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU7-57P-201 | ENST00000459540 | 60 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC080013.2-201 | ENST00000460866 | 323 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC010210.1-203 | ENST00000513905 | 260 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC096725.1-201 | ENST00000514266 | 313 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA31.15-201 | ENST00000516771 | 132 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AP003171.1-201 | ENST00000532770 | 266 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC024614.2-201 | ENST00000577584 | 372 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | uc_338.28-201 | ENST00000612082 | 187 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL121890.5-201 | ENST00000620848 | 304 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | EFR3A-202 | ENST00000519656 | 5247 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | KIAA1841-211 | ENST00000612149 | 4202 nt | TSL 5 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORD32B-201 | ENST00000364460 | 84 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-198P-201 | ENST00000384258 | 104 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.495-201 | ENST00000384435 | 112 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | TRAJ31-201 | ENST00000390506 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC016717.1-201 | ENST00000448918 | 286 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL441985.1-201 | ENST00000457727 | 251 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPS26P45-201 | ENST00000471748 | 340 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC010457.1-201 | ENST00000510469 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU5F-4P-201 | ENST00000516581 | 114 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.690-201 | ENST00000516603 | 95 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | FNBP1L-203 | ENST00000370253 | 3889 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC026241.1-201 | ENST00000517873 | 2142 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SPAM1-206 | ENST00000460182 | 2154 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1080P-201 | ENST00000383982 | 107 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-136P-201 | ENST00000384663 | 107 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR23A-201 | ENST00000385245 | 73 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP511-201 | ENST00000410487 | 115 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.617-201 | ENST00000410920 | 90 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPL30P14-201 | ENST00000482744 | 348 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP282-201 | ENST00000516355 | 108 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC131055.1-201 | ENST00000584626 | 316 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL929325.1-201 | ENST00000603096 | 117 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | UGP2-230 | ENST00000626380 | 276 nt | TSL 5 BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ZMYM1-203 | ENST00000373330 | 4203 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ELF1-201 | ENST00000239882 | 3566 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AKAP9-202 | ENST00000358100 | 10309 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | PRKG1-205 | ENST00000401604 | 5922 nt | TSL 5 BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ASPN-202 | ENST00000375544 | 2470 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | DEFB119-202 | ENST00000376315 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.510-201 | ENST00000384511 | 114 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC079760.1-201 | ENST00000456952 | 202 nt | TSL 3 BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPL36AP48-201 | ENST00000485521 | 314 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1299P-201 | ENST00000516316 | 100 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPL12P50-201 | ENST00000603116 | 116 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Six3os1_7.1-201 | ENST00000621512 | 201 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ZNF804A-202 | ENST00000613975 | 3986 nt | TSL 5 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORD114-7-201 | ENST00000362520 | 77 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-674P-201 | ENST00000363831 | 107 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA72-201 | ENST00000384339 | 132 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-750P-201 | ENST00000390946 | 107 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |