Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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