Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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