Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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SKP2Q13309 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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