Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NME3Q13232 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
NME3Q13232 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NME3Q13232 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NME3Q13232 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NME3Q13232 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NME3Q13232 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NME3Q13232 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NME3Q13232 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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