Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
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IFT88Q13099 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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IFT88Q13099 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IFT88Q13099 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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