Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
STX4Q12846 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
STX4Q12846 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
STX4Q12846 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
STX4Q12846 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX4Q12846 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX4Q12846 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX4Q12846 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
STX4Q12846 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX4Q12846 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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