Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms