Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
TTPAP49638 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TTPAP49638 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TTPAP49638 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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