Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPOP30536 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPOP30536 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPOP30536 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPOP30536 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPOP30536 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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