Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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PTPRMP28827 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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PTPRMP28827 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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PTPRMP28827 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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PTPRMP28827 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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PTPRMP28827 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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PTPRMP28827 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRMP28827 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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PTPRMP28827 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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PTPRMP28827 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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PTPRMP28827 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRMP28827 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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