Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PKHD1P08F94 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PKHD1P08F94 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PKHD1P08F94 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PKHD1P08F94 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PKHD1P08F94 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKHD1P08F94 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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