Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SH3BP1Q9Y3L3 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms