Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PUF60Q9UHX1 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PUF60Q9UHX1 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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