Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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