Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms