Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRRTQ9BXP5 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRRTQ9BXP5 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRRTQ9BXP5 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms