Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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