Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PITRM1Q5JRX3 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PITRM1Q5JRX3 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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