Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SP6Q3SY56 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms