Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTL8BQ17RB0 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.3 ms