Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM187BQ17R55 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms