Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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