Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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