Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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