Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms