Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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VPS72Q15906 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VPS72Q15906 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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