Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALX1Q15699 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALX1Q15699 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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