Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.9 ms