Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
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SYCP1Q15431 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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SYCP1Q15431 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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SYCP1Q15431 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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SYCP1Q15431 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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SYCP1Q15431 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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SYCP1Q15431 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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SYCP1Q15431 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SYCP1Q15431 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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